Um dos projetos geridos pela Fundação é o Programa de Melhoramento Genético de Milho, em parceira com Embrapa e Epamig.

O objetivo é buscar o desenvolvimento de cultivares produtivas e inovadoras, com características de resistência a pragas e doenças, tolerância aos estresses, eficiência no uso de nutrientes e maior qualidade nutricional. Produtos originados destas linhas de pesquisa têm forte apelo comercial e social, portanto, estão em consonância com as demandas do mercado e da sociedade.

A FTPD busca dar oportunidades para empresas nacionais no mercado de sementes, exercendo um papel regulador e assegurando a soberania nacional em termos de material genético.